עוד כותב בן-חיים: בשנות הנהגתו הואשם הרב שך בחידוש המאבקים בין החסידים ל"מתנגדים" – הליטאים, זאת בשל המאבק החריף שניהל נגד חסידות חב"ד. הוא גם פילג את "אגודת ישראל" והקים את "דגל התורה", פילג את "המודיע" וייסד את "יתד נאמן" ועוד, תוך טענה כי לא מדובר בחידוש המלחמה שהכריז הגאון מוילנא נגד החסידות לפני למעלה מ-200 שנה, מיד עם תחילת עלייתה. מלחמה מרה שדעכה במשך השנים כשהחרדים התאחדו מול "האויב" החילוני ומול הציונות וכשהתברר שתנועת החסידות רחוקה מלערער את חומות היהדות ההלכתית, כנראה להפך. טענתו הרב שך ותומכיו היתה כי המאבק בחב"ד היה מאבק מקומי נגד התסיסה המשיחית מבית מדרשו של האדמו"ר האחרון מחב"ד הרב מנחם מנדל שניאורסון.