בעוד כמה בימות מאנ"ש התלהבו באופן מוזר מרעיון הקמת העתק של בית-המקדש בברזיל, דווקא כמה אישי-ציבור שאינם חרדים הביעו התנגדות למהלך.

עיתון "מעריב" מדווח הבוקר (רביעי) כי התוכנית להקים העתק של בית המקדש בעיר סאו פאולו שבברזיל כבר הצליחה להרגיז כמה חברי כנסת: ח"כ מיכאל בן ארי (האיחוד הלאומי) שלח אתמול מכתב לשגריר ברזיל בישראל ובו הביע מחאה על התכנית. "חבל שהמוני מאמינים ברזילאים ישלו את עצמם" כתב בן ארי "בית המקדש הוא לא רק המבנה אלא גם המקום - הר הבית ובעיקר הרעיון של 'כי מציון תצא תורה ודבר השם מירושלים'".
  
על-פי הדיווח, בן ארי גם הציע לאנשי הכנסייה האוניברסלית של מלכות אלוקים העומדת מאחורי המיזם "לזנוח את הפרויקט הגרנדיוזי ולהשקיע את הכסף בהעברת מסגד אל אקצה לברזיל כך שעם ישראל יוכל לקיים את הציווי לבנות בית בחירה שיהווה אור לגויים‭."‬

למחאה הצטרף גם ח"כ אריה אלדד (האיחוד הלאומי ) שהניסיון להקים בברזיל כנסייה בצורת בית המקדש הראשון היא בעצם ניסיון לרשת את היהדות גם בסממני הפולחן שלה‭."‬

ח"כ הרב מנחם אליעזר מוזס יו"ר סיעת יהדות התורה כינה את מיזם בית המקדש בברזיל רעיון הזוי "היהודים מאמינים שבית המקדש השלישי ירד מהשמים כשהמשיח יבוא‭."‬

אשר בן שלמה חבר וועד הפועל של ההסתדרות הציונית העולמית העומד בראש המאבק של אנוסי ברזיל להשבתם לחיק העם היהודי אמר כי הבישוף מסאדו העומד מאחורי הפרויקט הגרנדיוזי עושה שימוש בלתי ראוי בחזון בית המקדש. על פי התוכנית כנסיית בית המקדש תיבנה בעלות של 200 מיליון דולר ותהיה גבוהה פי שניים מפסל ישו המשקיף על ריו דה ז'נרו.